Jako piłkarz grał w latach 1952-1967, natomiast jego kariera trenerska odbywała się w latach 1970-2002.

Cesare swoją karierę rozpoczął w 1952 roku , kiedy to zaczął grę w Triestinie, w której to uczył się przez dwa sezony, występując w 32 meczach. W 1954 roku przeniósł się do AC Milan, w którym to zdobył swój pierwszy tytuł mistrzowski w Serie A. W mediolańskim klubie wystąpił w 347 meczach, a w 1961 roku został kapitanem. Zdobył tam 4 tytuły w Serie A oraz Puchar Europy. Maldini zadebiutował w reprezentacji Włoch w 1960 roku, grając w niej przez 3 sezony i występując w 14 spotkaniach. W latach 1966-1967 trenował w Torino FC.

Swoją karierę trenerską rozpoczął w 1970 roku w Mediolanie jako asystent trenera Nereo Rocco, zaś w latach 1972-1974 pełnił już funkcję trenera w AC Milan. Trenował jeszcze takie drużyny jak: US Foggia, Ternana czy AC Parma. Przez 10 lat (1986-1996) sprawował opiekę nad kadrą narodową Włoch do lat 21. W latach 1996-1998 trenował włoską reprezentację, której udało się zakwalifikować w 1998 roku do Mundialu. Swoją karierę trenerską zakończył w 2002 roku, po roku spędzonym z reprezentacją Paragwaju. Przez krótki okres pracował jako osoba poszukująca nowych talentów, jak również jako analityk sportowy. 

Cesare Maldini zmarł w wieku 84 lat, jednakże przyczyna jego śmierci nie została ujawniona.